Publications of Robert L. Shoeman

Nass, K.; Foucar, L.; Barends, T.; Hartmann, E.; Botha, S.; Shoeman, R. L.; Doak, B.; Alonso-Mori, R.; Aquila, A.; Bajt, S. et al.; Barty, A.; Bean, R.; Beyerlein, K. R.; Bublitz, M.; Drachmann, N.; Gregersen, J.; Jönsson, H. O.; Kabsch, W.; Kassemeyer, S.; Koglin, J. E.; Krumrey, M.; Mattle, D.; Messerschmidt, M.; Nissen, P.; Reinhard, L.; Sitsel, O.; Sokaras, D.; Williams, G. J.; Hau-Riege, S.; Timneanu, N.; Caleman, C.; Chapman, H. N.; Boutet, S.; Schlichting, I.: Indications of radiation damage in ferredoxin microcrystals using high-intensity X-FEL beams. Journal of Synchrotron Radiation 22 (2), pp. 225 - 238 (2015)

Botha, S.; Nass, K.; Barends, T.; Kabsch, W.; Latz, B.; Dworkowski, F.; Foucar, L.; Panepucci, E.; Wang, M.; Shoeman, R. L. et al.; Schlichting, I.; Doak, B.: Room-temperature serial crystallography at synchrotron X-ray sources using slowly flowing free-standing high-viscosity microstreams. Acta Crystallographica. Section D: Biological Crystallography (Copenhagen) 71 (2), pp. 387 - 397 (2015)

Arnlund, D.; Johansson, L. C.; Wickstrand, C.; Barty, A.; Williams, G. J.; Malmerberg, E.; Davidsson, J.; Milathianaki, D.; DePonte, D. P.; Shoeman, R. L. et al.; Wang, D.; James, D.; Katona, G.; Westenhoff, S.; White, T. A.; Aquila, A.; Bari, S.; Berntsen, P.; Bogan, M.; van Driel, T. B.; Doak, R. B.; Kjær, K. S.; Frank, M.; Fromme, R.; Grotjohann, I.; Henning, R.; Hunter, M. S.; Kirian, R. A.; Kosheleva, I.; Kupitz, C.; Liang, M.; Martin, A. V.; Nielsen, M. M.; Messerschmidt, M.; Seibert, M. M.; Sjöhamn, J.; Stellato, F.; Weierstall, U.; Zatsepin, N. A.; Spence, J. C. H.; Fromme, P.; Schlichting, I.; Boutet, S.; Groenhof, G.; Chapman, H. N.; Neutze, R.: Visualizing a protein quake with time-resolved X-ray scattering at a free-electron laser. Nature methods 11 (9), pp. 923 - 926 (2014)

Kupitz, C.; Basu, S.; Grotjohann, I.; Fromme, R.; Zatsepin, N. A.; Rendek, K. N.; Hunter, M. S.; Shoeman, R. L.; White, T. A.; Wang, D. et al.; James, D.; Yang, J.-H.; Cobb, D. E.; Reeder, B.; Sierra, R. G.; Liu, H.; Barty, A.; Aquila, A. L.; Deponte, D.; Kirian, R. A.; Bari, S.; Bergkamp, J. J.; Beyerlein, K. R.; Bogan, M. J.; Caleman, C.; Chao, T.-C.; Conrad, C. E.; Davis, K. M.; Fleckenstein, H.; Galli, L.; Hau-Riege, S. P.; Kassemeyer, S.; Laksmono, H.; Liang, M.; Lomb, L.; Marchesini, S.; Martin, A. V.; Messerschmidt, M.; Milathianaki, D.; Nass, K.; Ros, A.; Roy-Chowdhury, S.; Schmidt, K.; Seibert, M.; Steinbrener, J.; Stellato, F.; Yan, L.; Yoon, C.; Moore, T. A.; Moore, A. L.; Pushkar, Y.; Williams, G. J.; Boutet, S.; Doak, R. B.; Weierstall, U.; Frank, M.; Chapman, H. N.; Spence, J. C. H.; Fromme, P.: Serial time-resolved crystallography of photosystem II using a femtosecond X-ray laser. Nature 513 (7517), pp. 261 - 265 (2014)

Sawaya, M. R.; Cascio, D.; Gingery, M.; Rodriguez, J.; Goldschmidt, L.; Colletier, J.-P.; Messerschmidt, M. M.; Boutet, S.; Koglin, J. E.; Williams, G. J. et al.; Brewster, A. S.; Nass, K.; Hattne, J.; Botha, S.; Doak, B.; Shoeman, R. L.; DePonte, D. P.; Park, H.-W.; Federici, B. A.; Sauter, N. K.; Schlichting, I.; Eisenberg, D. S.: Protein crystal structure obtained at 2.9 Å resolution from injecting bacterial cells into an X-ray free-electron laser beam. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 111 (35), pp. 12769 - 12774 (2014)

Lee, H.-H.; Cherni, I.; Yu, H.; Fromme, R.; Doran, J. D.; Grotjohann, I.; Mittman, M.; Basu, S.; Deb, A.; Dörner, K. et al.; Aquila, A.; Barty, A.; Boutet, S.; Chapman, H. N.; Doak, R. B.; Hunter, M. S.; James, D.; Richard, A. K.; Kupitz, C.; Lawrence, R. M.; Liu, H.; Nass, K.; Schlichting, I.; Schmidt, K. E.; Seibert, M. M.; Shoeman, R. L.; Spence, J. C. H.; Stellato, F.; Weierstall, U.; Williams, G. J.; Yoon, C.; Wang, D.; Zatsepin, N. A.; Hogue, B. G.; Matoba, N.; Frommea, P.; Mor, T. S.: Coherent diffractive imaging; Photoreceptors; Analytical Protein Biochemistry; Coherent diffractive imaging. IUCrJ 1 (5), pp. 305 - 317 (2014)

Lee, H.-H.; Cherni, I.; Yu, H.; Fromme, R.; Doran, J. D.; Grotjohann, I.; Mittman, M.; Basu, S.; Deb, A.; Dörner, K. et al.; Aquila, A.; Barty, A.; Boutet, S.; Chapman, H. N.; Doak, R. B.; Hunter, M. S.; James, D.; Kirian, R. A.; Kupitz, C.; Lawrence, R. M.; Liu, H.; Nass, K.; Schlichting, I.; Schmidt, K. E.; Seibert, M. M.; Shoeman, R. L.; Spence, J. C. H.; Stellato, F.; Weierstall, U.; Williams, G. J. J.; Yoon, C.; Wang, D.; Zatsepin, N. A.; Hogue, B. G.; Matoba, N.; Fromme, P.; Mor, T. S.: Expression, purification and crystallization of CTB-MPR, a candidate mucosal vaccine component against HIV-1. IUCrJ 1 (5), pp. 305 - 317 (2014)

Lindner, R.; Lou, X.; Reinstein, J.; Shoeman, R. L.; Hamprecht, F. A.; Winkler, A.: Hexicon 2: automated processing of hydrogen-deuterium exchange mass spectrometry data with improved deuteration distribution estimation. Journal of the American Society for Mass Spectrometry 25 (6), pp. 1018 - 1028 (2014)

Winkler, A.; Udvarhelyi, A.; Hartmann, E.; Reinstein, J.; Menzel, A.; Shoeman, R. L.; Schlichting, I.: Characterization of elements involved in allosteric light regulation of phosphodiesterase activity by comparison of different functional BlrP1 states. Journal of Molecular Biology (London) 426 (4), pp. 853 - 868 (2014)

Barends, T. R.M.; Foucar, L.; Botha, S.; Doak, B.; Shoeman, R. L.; Nass, K.; Koglin, J. E.; Williams, G. J.; Boutet, S.; Messerschmidt, M. et al.; Schlichting, I.: De novo protein crystal structure determination from X-ray free-electron laser data. Nature 505 (7482), pp. 244 - 247 (2014)

Johansson, L. C.; Arnlund, D.; Katona, G.; White, T. A.; Barty, A.; DePonte, D. P.; Shoeman, R. L.; Wickstrand, C.; Sharma, A.; Williams, G. J. et al.; Aquila, A.; Bogan, M. J.; Caleman, C.; Davidsson, J.; Doak, R. B.; Frank, M.; Fromme, R.; Galli, L.; Grotjohann, I.; Hunter, M. S.; Kassemeyer, S.; Kirian, R. A.; Kupitz, C.; Liang, M.; Lomb, L.; Malmerberg, E.; Martin, A. V.; Messerschmidt, M.; Nass, K.; Redecke, L.; Seibert, M. M.; Sjöhamn, J.; Steinbrener, J.; Stellato, F.; Wang, D.; Wahlgren, W. Y.; Weierstall, U.; Westenhoff, S.; Zatsepin, N. A.; Boutet, S.; Spence, J. C. H.; Schlichting, I.; Chapman, H. N.; Fromme, P.; Neutze, R.: Structure of a photosynthetic reaction centre determined by serial femtosecond crystallography. Nature Communications 4, 2911, pp. 1 - 7 (2013)

Park, H. J.; Loh, N. D.; Sierra, R. G.; Hampton, C. Y.; Starodub, D.; Martin, A. V.; Barty, A.; Aquila, A.; Schulz, J.; Steinbrener, J. F. et al.; Shoeman, R. L.; Lomb, L.; Kassemeyer, S.; Bostedt, C.; Bozek, J.; Epp , S. W.; Erk, B.; Hartmann, R.; Rolles, D.; Rudenko, A.; Rudek, B.; Foucar, L.; Kimmel, N.; Weidenspointner, G.; Hauser, G.; Holl, P.; Pedersoli, E.; Liang, M.; Hunter, M. S.; Gumprecht, L.; Coppola, N.; Wunderer, C.; Graafsma, H.; Maia, F. R.N.C.; Ekeberg, T.; Hantke, M.; Fleckenstein, H.; Hirsemann, H.; Nass, K.; Tobias, H. J.; Farquar, G. R.; Benner, W. H.; Hau-Riege, S.; Reich, C.; Hartmann, A.; Soltau, H.; Marchesini, S.; Bajt, S.; Barthelmess, M.; Strueder, L.; Ullrich, J.; Bucksbaum, P.; Frank, M.; Schlichting, I.; Chapman, H. N.; Bogan, M. J.; Elser, V.: Toward unsupervised single-shot diffractive imaging of heterogeneous particles using X-ray free-electron lasers. Optics Express 21 (23), pp. 28729 - 28742 (2013)

Demirci, H.; Sierra, R. G.; Laksmono, H.; Shoeman, R. L.; Botha, S.; Barends, T.; Nass, K.; Schlichting, I.; Doak, B.; Gati, C. et al.; Williams, G. J.; Boutet, S.; Messerschmidt, M.; Jogl, G.; Dahlberg, A. E.; Gregory, S. T.; Bogan, M. J.: Serial femtosecond X-ray diffraction of 30S ribosomal subunit microcrystals in liquid suspension at ambient temperature using an X-ray free-electron laser. Acta Crystallographica Section F: Structural Biology and Crystallization Communications 69 (9), pp. 1066 - 1069 (2013)

Pedersoli, E.; Loh, N. D.; Capotondi, F.; Hampton, C. Y.; Sierra, R. G.; Starodub, D.; Bostedt, C.; Bozek, J.; Nelson, A. J.; Aslam, M. et al.; Li, S.; Dravid, V. P.; Martin, A. V.; Aquila, A.; Barty, A.; Fleckenstein, H.; Gumprecht, L.; Liang, M.; Nass, K.; Schulz, J.; White, T. A.; Coppola, N.; Bajt, S.; Barthelmess, M.; Graafsma, H.; Hirsemann, H.; Wunderer, C.; Epp, S. W.; Erk, B.; Rudek, B.; Rudenko , A.; Foucar, L.; Kassemeyer, S.; Lomb, L.; Rolles, D.; Shoeman, R. L.; Steinbrener, J. F.; Hartmann, R.; Hartmann, A.; Hauser, G.; Holl, P.; Kimmel, N.; Reich, C.; Soltau, H.; Weidenspointner, G.; Benner, W. H.; Farquar, G. R.; Hau-Riege, S. P.; Hunter, M. S.; Ekeberg, T.; Hantke, M.; Maia, F. R. N. C.; Tobias, H. J.; Marchesini, S.; Frank, M.; Strüder, L.; Schlichting, I.; Ullrich, J.; Chapman, H. N.; Bucksbaum, P. H.; Kiskinova, M.; Bogan, M. J.: Mesoscale morphology of airborne core–shell nanoparticle clusters: X-ray laser coherent diffraction imaging. Journal of Physics B 46 (16), 164033, pp. 1 - 10 (2013)

Winkler, A.; Heintz, U.; Lindner, R.; Reinstein, J.; Shoeman, R. L.; Schlichting, I.: A ternary AppA–PpsR–DNA complex mediates light regulation of photosynthesis-related gene expression. Nature Structural and Molecular Biology 20 (7), pp. 859 - 867 (2013)

Loh, N. D.; Starodub, D.; Lomb, L.; Hampton, C. Y.; Martin, A. V.; Sierra, R. G.; Barty, A.; Aquila, A.; Schulz, J.; Steinbrener, J. F. et al.; Shoeman, R. L.; Kassemeyer, S.; Bostedt, C.; Bozek, J.; Epp, S. W.; Erk, B.; Hartmann, R.; Rolles, D.; Rudenko, A.; Rudek, B.; Foucar, L.; Kimmel, N.; Weidenspointner, G.; Hauser, G.; Holl, P.; Pedersoli, E.; Liang, M.; Hunter, M. S.; Gumprecht, L.; Coppola, N.; Wunderer, C.; Graafsma, H.; Maia, F. R.N.C.; Ekeberg, T.; Hantke, M.; Fleckenstein, H.; Hirsemann, H.; Nass, K.; White, T. A.; Tobias, H. J.; Farquar, G. R.; Benner, W. H.; Hau-Riege, S.; Reich, C.; Hartmann, A.; Soltau, H.; Marchesini, S.; Bajt, S.; Barthelmess, M.; Strueder, L.; Ullrich, J.; Bucksbaum, P.; Frank, M.; Schlichting, I.; Chapman, H. N.; Bogan, M. J.: Sensing the wavefront of X-ray free-electron lasers using aerosol spheres. Optics Express 21 (10), pp. 12385 - 12394 (2013)

Barends, T.; Foucar, L.; Shoeman, R. L.; Bari, S.; Epp, S. W.; Hartmann, R.; Hauser, G.; Huth, M.; Kieser, C.; Lomb, L. et al.; Motomura, K.; Nagaya, K.; Schmidt, C.; Strecker, R.; Anielski, D.; Boll, R.; Erk, B.; Fukuzawa, H.; Hartmann, E.; Hatsui, T.; Holl, P.; Inubushi, Y.; Ishikawa, T.; Kassemeyer, S.; Kaiser, C.; Koeck, F.; Kunishima, N.; Kurka, M.; Rolles, D.; Rudek, B.; Rudenko, A.; Sato, T.; Schroeter, C.-D.; Soltau, H.; Strueder, L.; Tanaka, T.; Togashi, T.; Tono, K.; Ullrich, J.; Yase, S.; Wada, S.-i.; Yao, M.; Yabashi, M.; Uedag, K.; Schlichting, I.: Anomalous signal from S atoms in protein crystallographic data from an X-ray free-electron laser. Acta Crystallographica. Section D: Biological Crystallography (Copenhagen) 69 (5), pp. 838 - 842 (2013)

Barends, T.; Brosi, R. W. W.; Steinmetz, A.; Scherer, A.; Hartmann, E.; Eschenbach, J.; Lorenz, T.; Seidel, R.; Shoeman, R. L.; Zimmermann, S. et al.; Bittl, R.; Schlichting, I.; Reinstein, J.: Combining crystallography and EPR: crystal and solution structures of the multidomain cochaperone DnaJ. Acta Crystallographica. Section D: Biological Crystallography (Copenhagen) 69 (8), pp. 1540 - 1552 (2013)

Redecke, L.; Nass, K.; DePonte, D. P.; White, T. A.; Rehders, D.; Barty, A.; Stellato, F.; Liang, M.; Barends, T. R.M.; Boutet, S. et al.; Williams, G. J.; Messerschmidt, M.; Seibert, M. M.; Aquila, A.; Arnlund, D.; Bajt, S.; Barth, T.; Bogan, M. J.; Caleman, C.; Chao, T.; Doak, R. B.; Fleckenstein, H.; Frank, M.; Fromme, R.; Galli, L.; Grotjohann, I.; Hunter, M. S.; Johansson, L. C.; Kassemeyer, S.; Katona, G.; Kirian, R. A.; Koopmann, R.; Kupitz, C.; Lomb, L.; Martin, A. V.; Mogk, S.; Neutze, R.; Shoeman, R. L.; Steinbrener, J.; Timneanu, N.; Wang, D.; Weierstall, U.; Zatsepin, N. A.; Spence, J. C. H.; Fromme, P.; Schlichting, I.; Duszenko, M.; Betzel, C.; Chapman, H. N.: Natively inhibited Trypanosoma brucei cathepsin B structure determined by using an X-ray laser. Science 339 (6116), pp. 227 - 230 (2013)

Starodub, D.; Aquila, A.; Bajt, S.; Barthelmess, M.; Barty, A.; Bostedt, C.; Bozek, J. D.; Coppola, N.; Doak, R. B.; Epp, S. W. et al.; Erk, B.; Foucar, L.; Gumprecht, L.; Hampton, C. Y.; Hartmann, A.; Hartmann, R.; Holl, P.; Kassemeyer, S.; Kimmel, N.; Laksmono, H.; Liang, M.; Loh, N.-T. D.; Lomb, L.; Martin, A. V.; Nass, K.; Reich, C.; Rolles, D.; Rudek, B.; Rudenko, A.; Schulz, J.; Shoeman, R. L.; Sierra, R. G.; Soltau, H.; Steinbrener, J.; Stellato, F.; Stern, S.; Weidenspointner, G.; Frank, M.; Ullrich, J.; Strüder, L.; Schlichting, I.; Chapman, H. N.; Spence, J. C. H.; Bogan, M. J.: Single-particle structure determination by correlations of snapshot X-ray diffraction patterns. Nature Communications 3, 1276, pp. 1 - 7 (2012)