Publications of Thomas Barends

Barends, T.; Brosi, R. W. W.; Steinmetz, A.; Scherer, A.; Hartmann, E.; Eschenbach, J.; Lorenz, T.; Seidel, R.; Shoeman, R. L.; Zimmermann, S. et al.; Bittl, R.; Schlichting, I.; Reinstein, J.: Combining crystallography and EPR: crystal and solution structures of the multidomain cochaperone DnaJ. Acta Crystallographica. Section D: Biological Crystallography (Copenhagen) 69 (8), pp. 1540 - 1552 (2013)

Maalcke, W. J.; Dietl, A.; Marritt, S. J.; Butt, J. N.; Jetten, M. S.M.; T.Keltjens, J.; Barends, T.; Kartal, B.: Structural basis of biological NO generation by octaheme oxidoreductases. The Journal of Biological Chemistry 289 (3), pp. 1228 - 1242 (2013)

Redecke, L.; Nass, K.; DePonte, D. P.; White, T. A.; Rehders, D.; Barty, A.; Stellato, F.; Liang, M.; Barends, T. R.M.; Boutet, S. et al.; Williams, G. J.; Messerschmidt, M.; Seibert, M. M.; Aquila, A.; Arnlund, D.; Bajt, S.; Barth, T.; Bogan, M. J.; Caleman, C.; Chao, T.; Doak, R. B.; Fleckenstein, H.; Frank, M.; Fromme, R.; Galli, L.; Grotjohann, I.; Hunter, M. S.; Johansson, L. C.; Kassemeyer, S.; Katona, G.; Kirian, R. A.; Koopmann, R.; Kupitz, C.; Lomb, L.; Martin, A. V.; Mogk, S.; Neutze, R.; Shoeman, R. L.; Steinbrener, J.; Timneanu, N.; Wang, D.; Weierstall, U.; Zatsepin, N. A.; Spence, J. C. H.; Fromme, P.; Schlichting, I.; Duszenko, M.; Betzel, C.; Chapman, H. N.: Natively inhibited Trypanosoma brucei cathepsin B structure determined by using an X-ray laser. Science 339 (6116), pp. 227 - 230 (2013)

Benjdia, A.; Heil, K.; Barends, T.; Carell, T.; Schlichting, I.: Structural insights into recognition and repair of UV-DNA damage by Spore Photoproduct Lyase, a radical SAM enzyme. Nucleic Acids Research (London) 40 (18), pp. 9308 - 9318 (2012)

Boutet, S.; Lomb, L.; Williams, G. J.; Barends, T.; Aquila, A.; Doak, R. B.; Weierstall, U.; DePonte, D. P.; Steinbrener, J.; Shoeman, R. L. et al.; Messerschmidt, M.; Barty, A.; White, T. A.; Kassemeyer, S.; Kirian, R. A.; Seibert, M. M.; Montanez, P. A.; Kenney, C.; Herbst, R.; Hart, P.; Pines, J.; Haller, G.; Gruner, S. M.; Philipp, H. T.; Tate, M. W.; Hromalik, M.; Koerner, L. J.; van Bakel, N.; Morse, J.; Ghonsalves, W.; Arnlund, D.; Bogan, M. J.; Caleman, C.; Fromme, R.; Hampton, C. Y.; Hunter, M. S.; Johansson, L.; Katona, G.; Kupitz, C.; Liang, M.; Martin, A. V.; Nass, K.; Redecke, L.; Stellato, F.; Timneanu, N.; Wang, D.; Zatsepin, N. A. A.; Schafer, D.; Defever, J.; Neutze, R.; Fromme, P.; Spence, J. C. H.; Chapman, H. N.; Schlichting, I.: High-resolution protein structure determination by serial femtosecond crystallography. Science 337 (6092), pp. 362 - 364 (2012)

Benz, J.; Sendlmeier, C.; Barends, T.; Meinhart, A.: Structural Insights into the Effector-Immunity System Tse1/Tsi1 from Pseudomonas aeruginosa. PLoS One 7 (7), e40453, pp. 1 - 10 (2012)

Zarrine-Afsar, A.; Barends, T.; Müller, C.; Fuchs, M. R.; Lomb, L.; Schlichting, I.; Miller, R.J. D.: Crystallography on a chip. Acta Crystallographica. Section D: Biological Crystallography (Copenhagen) 68 (3), pp. 321 - 323 (2012)

Kassemeyer, S.; Steinbrener, J.; Lomb, L.; Hartmann, E.; Aquila, A.; Barty, A.; Martin, A. V.; Hampton, C. Y.; Bajt, S.; Barthelmess, M. et al.; Barends, T.; Bostedt, C.; Bott, M.; Bozek, J. D.; Coppola, N.; Cryle, M.; DePonte, D. P.; Doak, R. B.; Epp, S. W.; Erk, B.; Fleckenstein, H.; Foucar, L.; Graafsma, H.; Gumprecht, L.; Hartmann, A.; Hartmann, R.; Hauser, G.; Hirsemann, H.; Hömke, A.; Holl, P.; Jönsson, O.; Kimmel, N.; Krasniqi, F.; Liang, M.; Maia, F. R.N.C.; Marchesini, S.; Nass, K.; Reich, C.; Rolles, D.; Rudek, B.; Rudenko, A.; Schmidt, C.; Schulz, J.; Shoeman, R. L.; Sierra, R. G.; Soltau, H.; Spence, J. C. H.; Starodub, D.; Stellato, F.; Stern, S.; Stier, G.; Svenda, M.; Weidenspointner, G.; Weierstall, U.; White, T. A.; Wunderer, C. B.; Frank, M.; Chapman, H. N.; Joachim, U.; Strüder, L.; Bogan, M. J.; Schlichting, I.: Femtosecond free-electron laser x-ray diffraction data sets for algorithm development. Optics Express 20 (4), pp. 4149 - 4158 (2012)

Aquila, A.; Hunter, M. S.; Doak, R. B.; Kirian, R. A.; Fromme, P.; White, T. A.; Andreasson, J.; Arnlund, D.; Bajt, S.; Barends, T. et al.; Barthelmess, M.; Bogan, M. J.; Bostedt, C.; Bottin, H.; Bozek, J. D.; Caleman, C.; Coppola, N.; Davidsson, J.; DePonte, D. P.; Elser, V.; Epp, S. W.; Erk, B.; Fleckenstein, H.; Foucar, L.; Frank, M.; Fromme, R.; Graafsma, H.; Grotjohann, I.; Gumprecht, L.; Hajdu, J.; Hampton, C. Y.; Hartmann, A.; Hartmann, R.; Hau−Riege, S. P.; Hauser, G.; Hirsemann, H.; Holl, P.; Holton, J. M.; Hömke, A.; Johansson, L.; Kimmel, N.; Kassemeyer, S.; Krasniqi, F.; Kühnel, K.; Liang, M.; Lomb, L.; Malmerberg, E.; Marchesini, S.; Martin, A. V.; Maia, F. R.N.C.; Messerschmidt, M.; Nass, K.; Reich, C.; Neutze, R.; Rolles, D.; Rudek, B.; Rudenko, A.; Schlichting, I.; Schmidt, C.; Schmidt, K. E.; Schulz, J.; Seibert, M. M.; Shoeman, R. L.; Sierra, R. G.; Soltau, H.; Starodub, D.; Stellato, F.; Stern, S.; Strüder, L.; Timneanu, N.; Ullrich, J.; Wang, X.; Williams, G. J.; Weidenspointner, G.; Weierstall, U.; Wunderer, C. B.; Barty, A.; Spence, J. C. H.; Chapman, H. N.: Time-resolved protein nanocrystallography using an X-ray free-electron laser. Optics Express 20 (3), pp. 2706 - 2716 (2012)

Barty, A.; Caleman, C.; Aquila, A.; Timneanu, N.; Lomb, L.; White, T. A.; Andreasson, J.; Arnlund, D.; Bajt, S.; Barends, T. et al.; Barthelmess, M.; Bogan, M. J.; Bostedt, C.; Bozek, J. D.; Coffee, R. N.; Coppola, N.; Davidsson, J.; DePonte, D. P.; Doak, R. B.; Ekeberg, T.; Elser, V.; Epp, S. W.; Erk, B.; Fleckenstein, H.; Foucar, L.; Fromme, P.; Graafsma, H.; Gumprecht, L.; Hajdu, J.; Hampton, C. Y.; Hartmann, R.; Hartmann, A.; Hauser, G.; Hirsemann, H.; Holl, P.; Hunter, M. S.; Johansson, L.; Kassemeyer, S.; Kimmel, N.; Kirian, R. A.; Liang, M.; Maia, F. R. N. C.; Malmerberg, E.; Marchesini, S.; Martin, A. V.; Nass, K.; Neutze, R.; Reich, C.; Rolles, D.; Rudek, B.; Rudenko, A.; Scott, H.; Schlichting, I.; Schulz, J.; Seibert, M. M.; Shoeman, R. L.; Sierra, R. G.; Soltau, H.; Spence, J. C. H.; Stellato, F.; Stern, S.; Strüder, L.; Ullrich, J.; Wang, X.; Weidenspointner, G.; Weierstall, U.; Wunderer, C. B.; Chapman, H. N.: Self-terminating diffraction gates femtosecond X-ray nanocrystallography measurements. Nature Photonics 6 (1), pp. 35 - 40 (2012)

Lomb, L.; Barends, T.; Kassemeyer, S.; Aquila, A.; Epp, S. W.; Erk, B.; Foucar, L.; Hartmann, R.; Rudek, B.; Rolles, D. et al.; Rudenko, A.; Shoeman, R. L.; Andreasson, J.; Bajt, S.; Barthelmess, M.; Barty, A.; Bogan, M. J.; Bostedt, C.; Bozek, J. D.; Caleman, C.; Coffee, R.; Coppola, N.; DePonte, D. P.; Doak, R. B.; Ekeberg, T.; Fleckenstein, H.; Fromme, P.; Gebhardt, M.; Graafsma, H.; Gumprecht, L.; Hampton, C. Y.; Hartmann, A.; Hauser, G.; Hirsemann, H.; Holl, P.; Holton1, J. M.; Hunter, M. S.; Kabsch, W.; Kimmel, N.; Kirian, R. A.; Liang, M.; Maia, F. R. N. C.; Meinhart, A.; Marchesini, S.; Martin, A. V.; Nass, K.; Reich, C.; Schulz, J.; Seibert, M. M.; Sierra, R. G.; Soltau, H.; Spence, J. C. H.; Steinbrener, J.; Stellato, F.; Stern, S.; Timneanu, N.; Wang, X.; Weidenspointner, G.; Weierstall, U.; White, T. A.; Wunderer, C. B.; Chapman, H. N.; Ullrich, J.; Strüder, L.; Schlichting, I.: Radiation damage in protein serial femtosecond crystallography using an x-ray free-electron laser. Physical Review B 84 (21), e214111, pp. 1 - 6 (2011)

Smeulders, M. J.; Barends, T.; Pol, A.; Scherer, A.; Zandvoort, M. H.; Udvarhelyi, A.; Khadem, A. F.; Menzel, A.; Hermans, J.; Shoeman, R. L. et al.; Wessels, H. J. C. T.; van den Heuvel, L. P.; Russ, L.; Schlichting, I.; Jetten, M. S. M.; Op den Camp, H. J. M.: Evolution of a new enzyme for carbon disulphide conversion by an acidothermophilic archaeon. Nature 478 (7369), pp. 412 - 416 (2011)

Martin, A. V.; Andreasson, J.; Aquila, A.; Bajt, S.; Barends, T.; Barthelmess, M.; Barty, A.; Benner, W. H.; Bostedt, C.; Bozek, J. D. et al.; Bucksbaum, P.; Caleman, C.; Coppola, N.; Deponte, D. P.; Ekeberg, T.; Epp, S. W.; Erk, B.; Farquar, G. R.; Fleckenstein, H.; Foucar, L.; Frank, M.; Gumprecht, L.; Hampton, C. Y.; Hantke, M.; Hartmann, A.; Hartmann, E.; Hartmann, R.; Hau−Riege, S. P.; Hauser, G.; Holl, P.; Hömke, A.; Jönsson, O.; Kassemeyer, S.; Kimmel, N.; Kiskinova, M.; Krasniqi, F.; Krzywinski, J.; Liang, M.; Loh, N. D.; Lomb, L.; Maia, F. R. N. C.; Marchesini, S.; Messerschmidt, M.; Nass, K.; Odic, D.; Pedersoli, E.; Reich, C.; Rolles, D.; Rudek, B.; Rudenko, A.; Schmidt, C.; Schultz, J.; Seibert, M. M.; Shoeman, R. L.; Sierra, R. G.; Soltau, H.; Starodub, D.; Steinbrener, J.; Stellato, F.; Strüder, L.; Svenda, M.; Tobias, H.; Ullrich, J.; Weidenspointner, G.; Westphal, D.; White, T. A.; Williams, G.; Hajdu, J.; Schlichting, I.; Bogan, M. J.; Chapman, H. N.: Single particle imaging with soft X-rays at the linac coherent light source. Proceedings of SPIE 8078, 807809, pp. 1 - 9 (2011)

Chapman, H. N.; Fromme, P.; Barty, A.; White, T. A.; Kirian, R. A.; Aquila, A.; Hunter, M. S.; Schulz, J.; DePonte, D. P.; Weierstall, U. et al.; Doak, R. B.; Filipe R. N. C. Maia, F. R. N. C.; Martin, A. V.; Schlichting, I.; Lomb, L.; Coppola, N.; Shoeman, R. L.; Epp, S. W.; Hartmann, R.; Rolles, D.; Rudenko, A.; Foucar, L.; Kimmel, N.; Weidenspointner, G.; Holl, P.; Liang, M.; Barthelmess, M.; Caleman, C.; Boutet, S.; Bogan, M. J.; Krzywinski, J.; Bostedt, C.; Bajt, S.; Gumprecht, L.; Rudek, B.; Erk, B.; Schmidt, C.; Hömke, A.; Reich, C.; Pietschner, D.; Strüder, L.; Hauser, G.; Gorke, H.; Ullrich, J.; Herrmann, S.; Schaller, G.; Schopper, F.; Soltau, H.; Kühnel, K.; Messerschmidt, M.; Bozek, J. D.; Hau−Riege, S. P.; Frank, M.; Hampton, C. Y.; Sierra, R. G.; Starodub, D.; Williams,, G. J.; Hajdu, J.; Timneanu, N.; Seibert, M. M.; Andreasson, J.; Rocker, A.; Jönsson, O.; Svenda, M.; Stern, S.; Nass, K.; Andritschke, R.; Schroeter, C.; Krasniqi, F.; Bott, M.; Schmidt, K. E.; Wang, X.; Grotjohann, I.; Holton, J. M.; Barends, T.; Neutze, R.; Marchesini, S.; Fromme, R.; Schorb, S.; Rupp, D.; Adolph, M.; Gorkhover, T.; Andersson, I.; Hirsemann, H.; Potdevin, G.; Graafsma, H.; Nilsson, B.; Spence, J. C. H.: Femtosecond X-ray protein nanocrystallography. Nature 470 (7332), pp. 73 - 77 (2011)

Lai, J.; Niks, D.; Wang, Y.; Domratcheva, T.; Barends, T.; Schwarz, F.; Olsen, R. A.; Elliott, D. W.; Fatmi, M. Q.; Chang, C. A. et al.; Schlichting, I.; Dunn, M. F.; Mueller, L.: X-ray and NMR crystallography in an enzyme active site: the indoline quinonoid intermediate in tryptophan synthase. Journal of the American Chemical Society 133 (1), pp. 4 - 7 (2011)

Jaenicke, E.; Büchler, K.; Markl, J.; Decker, H.; Barends, T.: Cupredoxin-like domains in haemocyanins. Biochemical Journal 426 (3), pp. 373 - 378 (2010)

Barends, T.; Werbeck, N. D.; Reinstein, J.: Disaggregases in 4 dimensions. Current Opinion in Structural Biology 20 (1), pp. 46 - 53 (2010)

Werbeck, N. D.; Kellner, J.; Barends, T.; Reinstein, J.: Nucleotide binding and allosteric modulation of the second AAA+ fomain of ClpB probed by transient kinetic studies. Biochemistry 48 (30), pp. 7240 - 7250 (2009)

Glas, A. F.; Maul, M. J.; Cryle, M.; Barends, T.; Schneider, S.; Kaya, E.; Schlichting, I.; Carell, T.: The archaeal cofactor F0 is a light-harvesting antenna chromophore in eukaryotes. Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America 106 (28), pp. 11540 - 11545 (2009)

Barends, T.; Hartmann, E.; Griese, J.; Beitlich, T.; Kirienko, N. V.; Ryjenkov, D. A.; Reinstein, J.; Shoeman, R. L.; Gomelsky, M.; Schlichting, I.: Structure and mechanism of a bacterial light-regulated cyclic nucleotide phosphodiesterase. Nature 459 (7249), pp. 1015 - 1018 (2009)