Publications of Ilme Schlichting

Johansson, L. C.; Arnlund, D.; White, T. A.; Katona, G.; DePonte, D. P.; Weierstall, U.; Doak, R. B.; Shoeman, R. L.; Lomb, L.; Malmerberg, E. et al.; Davidsson, J.; Nass, K.; Liang, M.; Andreasson, J.; Aquila, A.; Bajt, S.; Barthelmess, M.; Barty, A.; Bogan, M. J.; Bostedt, C.; Bozek, J. D.; Caleman, C.; Coffee, R. N.; Coppola, N.; Ekeberg, T.; Epp, S. W.; Erk, B.; Fleckenstein, H.; Foucar, L.; Graafsma, H.; Gumprecht, L.; Hajdu, J.; Hampton, C. Y.; Hartmann, R.; Hartmann, A.; Hauser, G.; Hirsemann, H.; Holl, P.; Hunter, M. S.; Kassemeyer, S.; Kimmel, N.; Kirian, R. A.; Maia, F. R. N. C.; Marchesini, S.; Martin, A. V.; Reich, C.; Rolles, D.; Rudek, B.; Rudenko, A.; Schlichting, I.; Schulz, J.; Seibert, M. M.; Sierra, R. G.; Soltau, H.; Starodub, D.; Stellato, F.; Stern, S.; Strüder, L.; Timneanu, N.; Ullrich, J.; Wahlgren, W. Y.; Wang, X.; Weidenspointner, G.; Wunderer, C.; Fromme, P.; Chapman, H. N.; Spence, J. C. H.; Neutze, R.: Lipidic phase membrane protein serial femtosecond crystallography. Nature methods 9 (3), pp. 263 - 265 (2012)

Koopmann, R.; Cupelli, K.; Redecke, L.; Nass, K.; DePonte, D. P.; White, T. A.; Stellato, F.; Rehders, D.; Liang, M.; Andreasson, J. et al.; Aquila, A.; Bajt, S.; Barthelmess, M.; Barty, A.; Bogan, M. J.; Bostedt, C.; Boutet, S.; Bozek, J. D.; Caleman, C.; Coppola, N.; Davidsson, J.; Doak, R. B.; Ekeberg, T.; Epp, S. W.; Erk, B.; Fleckenstein, H.; Foucar, L.; Graafsma, H.; Gumprecht, L.; Hajdu, J.; Hampton, C. Y.; Hartmann, A.; Hartmann, R.; Hauser, G.; Hirsemann, H.; Holl, P.; Hunter, M. S.; Kassemeyer, S.; Kirian, R. A.; Lomb, L.; Maia, F. R. N. C.; Kimmel, N.; Martin, A. V.; Messerschmidt, M.; Reich, C.; Rolles, D.; Rudek, B.; Rudenko, A.; Schlichting, I.; Schulz, J.; Seibert, M. M.; Shoeman, R. L.; Sierra, R. G.; Soltau, H.; Stern, S.; Strüder, L.; Timneanu, N.; Ullrich, J.; Wang, X.; Weidenspointner, G.; Weierstall, U.; Williams, G. J.; Wunderer, C. B.; Fromme, P.; Spence, J. C. H.; Stehle, T.; Chapman, H. N.; Betzel, C.; Duszenko, M.: In vivo protein crystallization opens new routes in structural biology. Nature methods 9 (3), pp. 259 - 262 (2012)

Barty, A.; Caleman, C.; Aquila, A.; Timneanu, N.; Lomb, L.; White, T. A.; Andreasson, J.; Arnlund, D.; Bajt, S.; Barends, T. et al.; Barthelmess, M.; Bogan, M. J.; Bostedt, C.; Bozek, J. D.; Coffee, R. N.; Coppola, N.; Davidsson, J.; DePonte, D. P.; Doak, R. B.; Ekeberg, T.; Elser, V.; Epp, S. W.; Erk, B.; Fleckenstein, H.; Foucar, L.; Fromme, P.; Graafsma, H.; Gumprecht, L.; Hajdu, J.; Hampton, C. Y.; Hartmann, R.; Hartmann, A.; Hauser, G.; Hirsemann, H.; Holl, P.; Hunter, M. S.; Johansson, L.; Kassemeyer, S.; Kimmel, N.; Kirian, R. A.; Liang, M.; Maia, F. R. N. C.; Malmerberg, E.; Marchesini, S.; Martin, A. V.; Nass, K.; Neutze, R.; Reich, C.; Rolles, D.; Rudek, B.; Rudenko, A.; Scott, H.; Schlichting, I.; Schulz, J.; Seibert, M. M.; Shoeman, R. L.; Sierra, R. G.; Soltau, H.; Spence, J. C. H.; Stellato, F.; Stern, S.; Strüder, L.; Ullrich, J.; Wang, X.; Weidenspointner, G.; Weierstall, U.; Wunderer, C. B.; Chapman, H. N.: Self-terminating diffraction gates femtosecond X-ray nanocrystallography measurements. Nature Photonics 6 (1), pp. 35 - 40 (2012)

Lomb, L.; Barends, T.; Kassemeyer, S.; Aquila, A.; Epp, S. W.; Erk, B.; Foucar, L.; Hartmann, R.; Rudek, B.; Rolles, D. et al.; Rudenko, A.; Shoeman, R. L.; Andreasson, J.; Bajt, S.; Barthelmess, M.; Barty, A.; Bogan, M. J.; Bostedt, C.; Bozek, J. D.; Caleman, C.; Coffee, R.; Coppola, N.; DePonte, D. P.; Doak, R. B.; Ekeberg, T.; Fleckenstein, H.; Fromme, P.; Gebhardt, M.; Graafsma, H.; Gumprecht, L.; Hampton, C. Y.; Hartmann, A.; Hauser, G.; Hirsemann, H.; Holl, P.; Holton1, J. M.; Hunter, M. S.; Kabsch, W.; Kimmel, N.; Kirian, R. A.; Liang, M.; Maia, F. R. N. C.; Meinhart, A.; Marchesini, S.; Martin, A. V.; Nass, K.; Reich, C.; Schulz, J.; Seibert, M. M.; Sierra, R. G.; Soltau, H.; Spence, J. C. H.; Steinbrener, J.; Stellato, F.; Stern, S.; Timneanu, N.; Wang, X.; Weidenspointner, G.; Weierstall, U.; White, T. A.; Wunderer, C. B.; Chapman, H. N.; Ullrich, J.; Strüder, L.; Schlichting, I.: Radiation damage in protein serial femtosecond crystallography using an x-ray free-electron laser. Physical Review B 84 (21), e214111, pp. 1 - 6 (2011)

Smeulders, M. J.; Barends, T.; Pol, A.; Scherer, A.; Zandvoort, M. H.; Udvarhelyi, A.; Khadem, A. F.; Menzel, A.; Hermans, J.; Shoeman, R. L. et al.; Wessels, H. J. C. T.; van den Heuvel, L. P.; Russ, L.; Schlichting, I.; Jetten, M. S. M.; Op den Camp, H. J. M.: Evolution of a new enzyme for carbon disulphide conversion by an acidothermophilic archaeon. Nature 478 (7369), pp. 412 - 416 (2011)

Yoon, C. H.; Schwander, P.; Abergel, C.; Andersson, I.; Andreasson, J.; Aquila, A.; Bajt, S.; Barthelmess, M.; Barty, A.; Bogan, M. J. et al.; Bostedt, C.; Bozek, J.; Chapman, H. N.; Claverie, J.-M.; Coppola, N.; DePonte, D. P.; Ekeberg,, T.; Epp, S. W.; Erk, B.; Fleckenstein, H.; Foucar, L.; Graafsma, H.; Gumprecht, L.; Hajdu, J.; Hampton, C. Y.; Hartmann, A.; Hartmann, E.; Hartmann, R.; Hauser, G.; Hirsemann, H.; Holl, P.; Kassemeyer, S.; Kimmel, N.; Kiskinova, M.; Liang, M.; Loh, N.-T. D.; Lomb, L.; Maia, F. R. N. C.; Martin, A. V.; Nass, K.; Pedersoli, E.; Reich, C.; Rolles, D.; Rudek, B.; Rudenko, A.; Schlichting, I.; Schulz, J.; Seibert, M. M.; Seltzer, V.; Shoeman, R. L.; Sierra, R. G.; Soltau, H.; Starodub, D.; Steinbrener, J.; Stier, G.; Strüder, L.; Svenda, M.; Ullrich, J.; Weidenspointner, G.; White, T. A.; Wunderer, C. B.; Ourmazd, A.: Unsupervised classification of single-particle X-ray diffraction snapshots by spectral clustering. Optics Express 19 (17), pp. 16542 - 16549 (2011)

Martin, A. V.; Andreasson, J.; Aquila, A.; Bajt, S.; Barends, T.; Barthelmess, M.; Barty, A.; Benner, W. H.; Bostedt, C.; Bozek, J. D. et al.; Bucksbaum, P.; Caleman, C.; Coppola, N.; Deponte, D. P.; Ekeberg, T.; Epp, S. W.; Erk, B.; Farquar, G. R.; Fleckenstein, H.; Foucar, L.; Frank, M.; Gumprecht, L.; Hampton, C. Y.; Hantke, M.; Hartmann, A.; Hartmann, E.; Hartmann, R.; Hau−Riege, S. P.; Hauser, G.; Holl, P.; Hömke, A.; Jönsson, O.; Kassemeyer, S.; Kimmel, N.; Kiskinova, M.; Krasniqi, F.; Krzywinski, J.; Liang, M.; Loh, N. D.; Lomb, L.; Maia, F. R. N. C.; Marchesini, S.; Messerschmidt, M.; Nass, K.; Odic, D.; Pedersoli, E.; Reich, C.; Rolles, D.; Rudek, B.; Rudenko, A.; Schmidt, C.; Schultz, J.; Seibert, M. M.; Shoeman, R. L.; Sierra, R. G.; Soltau, H.; Starodub, D.; Steinbrener, J.; Stellato, F.; Strüder, L.; Svenda, M.; Tobias, H.; Ullrich, J.; Weidenspointner, G.; Westphal, D.; White, T. A.; Williams, G.; Hajdu, J.; Schlichting, I.; Bogan, M. J.; Chapman, H. N.: Single particle imaging with soft X-rays at the linac coherent light source. Proceedings of SPIE 8078, 807809, pp. 1 - 9 (2011)

Khrenova, M. G.; Domratcheva, T.; Schlichting, I.; Grigorenko, B. L.; Nemukhin, A. V.: Computational characterization of reaction intermediates in the photocycle of the sensory domain of the AppA blue light photoreceptor. Photochemistry and Photobiology 87 (3), pp. 564 - 573 (2011)

Cryle, M.; Staaden, J.; Schlichting, I.: Structural characterization of CYP165D3, a cytochrome P450 involved in phenolic coupling in teicoplanin biosynthesis. Archives of Biochemistry and Biophysics 507 (1), pp. 163 - 173 (2011)

Chapman, H. N.; Fromme, P.; Barty, A.; White, T. A.; Kirian, R. A.; Aquila, A.; Hunter, M. S.; Schulz, J.; DePonte, D. P.; Weierstall, U. et al.; Doak, R. B.; Filipe R. N. C. Maia, F. R. N. C.; Martin, A. V.; Schlichting, I.; Lomb, L.; Coppola, N.; Shoeman, R. L.; Epp, S. W.; Hartmann, R.; Rolles, D.; Rudenko, A.; Foucar, L.; Kimmel, N.; Weidenspointner, G.; Holl, P.; Liang, M.; Barthelmess, M.; Caleman, C.; Boutet, S.; Bogan, M. J.; Krzywinski, J.; Bostedt, C.; Bajt, S.; Gumprecht, L.; Rudek, B.; Erk, B.; Schmidt, C.; Hömke, A.; Reich, C.; Pietschner, D.; Strüder, L.; Hauser, G.; Gorke, H.; Ullrich, J.; Herrmann, S.; Schaller, G.; Schopper, F.; Soltau, H.; Kühnel, K.; Messerschmidt, M.; Bozek, J. D.; Hau−Riege, S. P.; Frank, M.; Hampton, C. Y.; Sierra, R. G.; Starodub, D.; Williams,, G. J.; Hajdu, J.; Timneanu, N.; Seibert, M. M.; Andreasson, J.; Rocker, A.; Jönsson, O.; Svenda, M.; Stern, S.; Nass, K.; Andritschke, R.; Schroeter, C.; Krasniqi, F.; Bott, M.; Schmidt, K. E.; Wang, X.; Grotjohann, I.; Holton, J. M.; Barends, T.; Neutze, R.; Marchesini, S.; Fromme, R.; Schorb, S.; Rupp, D.; Adolph, M.; Gorkhover, T.; Andersson, I.; Hirsemann, H.; Potdevin, G.; Graafsma, H.; Nilsson, B.; Spence, J. C. H.: Femtosecond X-ray protein nanocrystallography. Nature 470 (7332), pp. 73 - 77 (2011)

Seibert, M. M.; Ekeberg, T.; Maia, F. R. N. C.; Svenda, M.; Andreasson, J.; Odic, D.; Jönsson, O.; Iwan, B.; Rocker, A.; Westphal, D. et al.; Hantke, M.; DePonte, D. P.; Barty, A.; Schulz, J.; Gumprecht, L.; Coppola, N.; Aquila, A.; Liang, M.; White, T. A.; Martin, A. V.; Caleman, C.; Stern, S.; Abergel, C.; Seltzer, V.; Claverie, J.; Bostedt, C.; Bozek, J. D.; Boutet, S.; Miahnahri, A. A.; Messerschmidt, M.; Krzywinski, J.; Williams, G. J.; Hodgson, K. O.; Bogan, M. J.; Hampton, C. Y.; Sierra, R. G.; Starodub, D.; Andersson, I.; Bajt, S.; Barthelmess, M.; Spence, J. C. H.; Fromme, P.; Weierstall, U.; Kirian, R. A.; Hunter, M. S.; Doak, R. B.; Marchesini, S.; Hau−Riege, S. P.; Frank, M.; Shoeman, R. L.; Lomb, L.; Epp, S. W.; Hartmann, R.; Rolles, D.; Rudenko, A.; Schmidt, C.; Foucar, L.; Kimmel, N.; Holl, P.; Rudek, B.; Erk, B.; Hömke, A.; Reich, C.; Pietschner, D.; Weidenspointner, G.; Strüder, L.; Hauser, G.; Gorke, H.; Ullrich, J.; Schlichting, I.; Herrmann, S.; Schaller, G.; Schopper, F.; Soltau, H.; Kühnel, K.; Andritschke, R.; Schroeter, C. D.; Krasniqi, F.; Bott, M.; Schorb, S.; Rupp, D.; Adolph, M.; Gorkhover, T.; Hirsemann, H.; Potdevin, G.; Graafsma, H.; Nilsson, B.; Chapman, H. N.; Hajdu, J.: Single mimivirus particles intercepted and imaged with an X-ray laser. Nature 470 (7332), pp. 78 - 81 (2011)

Lai, J.; Niks, D.; Wang, Y.; Domratcheva, T.; Barends, T.; Schwarz, F.; Olsen, R. A.; Elliott, D. W.; Fatmi, M. Q.; Chang, C. A. et al.; Schlichting, I.; Dunn, M. F.; Mueller, L.: X-ray and NMR crystallography in an enzyme active site: the indoline quinonoid intermediate in tryptophan synthase. Journal of the American Chemical Society 133 (1), pp. 4 - 7 (2011)

Bogan, M. J.; Boutet, S.; Barty, A.; Benner, W. H.; Frank, M.; Lomb, L.; Shoeman, R. L.; Starodub, D.; Seibert, M. M.; Hau-Riege, S. P. et al.; Woods, B.; Decorwin-Martin, P.; Bajt, S.; Schulz, J.; Rohner, U.; Iwan, B.; Timneanu, N.; Marchesini, S.; Schlichting, I.; Hajdu, J.; Chapman, H. N.: Single-shot femtosecond x-ray diffraction from randomly oriented ellipsoidal nanoparticles. Physical Review Special Topics Accelerators and Beams 13 (9), 094701, pp. 1 - 7 (2010)

Cryle, M.; Bell, S. G.; Schlichting, I.: Structural and biochemical characterization of the cytochrome P450 CypX (CYP134A1) from Bacillus subtilis: a cyclo-L-leucyl-L-leucyl dipeptide oxidase. Biochemistry 49 (34), pp. 7282 - 7296 (2010)

Cryle, M.; Meinhart, A.; Schlichting, I.: Structural characterization of OxyD, a cytochrome P450 involved in β-Hydroxytyrosine formation in vancomycin biosynthesis. The Journal of Biological Chemistry 285 (32), pp. 24562 - 24574 (2010)

Loh, N.-T. D.; Bogan, M. J.; Elser, V.; Barty, A.; Boutet, S.; Bajt, S.; Hajdu, J.; Ekeberg, T.; Maia, F. R. N. C.; Schulz, J. et al.; Seibert, M. M.; Iwan, B.; Timneanu, N.; Marchesini, S.; Schlichting, I.; Shoeman, R. L.; Lomb, L.; Frank, M.; Liang, M.; Chapman, H. N.: Cryptotomography: reconstructing 3D Fourier intensities from randomly oriented single-shot diffraction patterns. Physical Review Letters 104 (22), 225501, pp. 1 - 5 (2010)

Dierolf, M.; Thibault, P.; Menzel, A.; Kewish, C. M.; Jefimovs, K.; Schlichting, I.; von König, K.; Bunk, O.; Pfeiffer, F.: Ptychographic coherent diffractive imaging of weakly scattering specimens. New Journal of Physics 12 (3), pp. 35017 - 3530 (2010)

Strüder, L.; Epp, S. W.; Rolles, D.; Hartmann, R.; Holl, P.; Lutz, G.; Soltau, H.; Eckart, R.; Reich, C.; Heinzinger, K. et al.; Thamm, C.; Rudenko, A.; Krasniqi, F.; Kühnel, K. U.; Bauer, C.; Schroeter, C. D.; Moshammer, R.; Techert, S.; Miessner, D.; Porro, M.; Hälker, O.; Meidinger, N.; Kimmel, N.; Andritschke, R.; Schopper, F.; Weidenspointner, G.; Ziegler, A.; Pietschner, D.; Herrmann, S.; Pietsch, U.; Walenta, A.; Leitenberger, W.; Bostedt, C.; Möller, T.; Rupp, D.; Adolph, M.; Graafsma, H.; Hirsemann, H.; Gärtner, K.; Richter, R.; Foucar, L.; Shoeman, R. L.; Schlichting, I.; Ullrich, J.: Large-format, high-speed, X-ray pnCCDs combined with electron and ion imaging spectrometers in a multipurpose chamber for experiments at 4th generation light sources. Nuclear Instruments and Methods in Physics Research Section A 614 (3), pp. 483 - 496 (2010)

Domratcheva, T.; Schlichting, I.: Electronic structure of (6−4) DNA photoproduct repair involving a non-oxetane pathway. Journal of the American Chemical Society 131 (49), pp. 17793 - 17799 (2009)

Dierkers, A. T.; Niks, D.; Schlichting, I.; Dunn, M.: Tryptophan synthase: structure and function of the monovalent cation site. Biochemistry 48 (46), pp. 10997 - 11010 (2009)