Publications of R. Bruce Doak

Doak, R. B.; Shoeman, R. L.; Gorel, A.; Niziński, S.; Barends, T. R.M.; Schlichting, I.: Sheet-on-sheet fixed target data collection devices for serial crystallography at synchrotron and XFEL sources. Journal of Applied Crystallography 57 (6), pp. 1 - 8 (2024)

Barends, T. R.M.; Bhattacharyya, S.; Gorel, A.; Schiro, G.; Bacellar, C.; Cirelli, C.; Colletier, J.-P.; Foucar, L.; Grünbein, M. L.; Hartmann, E. et al.; Hilpert, M.; Johnson, P. J.M.; Kloos, M.; Knopp, G.; Marekha, B.; Nass, K.; Nass Kovacs, G.; Ozerov, D.; Stricker, M.; Weik, M.; Doak, R. B.; Shoeman, R. L.; Milne, C. J.; Huix-Rotllant, M.; Cammarata, M.; Schlichting, I.: Influence of pump laser fluence on ultrafast structural changes in myoglobin. Nature 626 (8000), pp. 905 - 911 (2024)

Doak, B.; Shoeman, R. L.; Gorel, A.; Barends, T. R. M.; Marekha, B.; Haacke, S.; Nizinski, S.; Schlichting, I.: Dynamic catcher for stabilization of high-viscosity extrusion jets. Journal of Applied Crystallography 56, pp. 903 - 907 (2023)

Adam, V.; Hadjidemetriou, K.; Jensen, N.; Shoeman, R. L.; Woodhouse, J.; Aquila, A.; Banneville, A.-S.; Barends, T. R. M.; Bezchastnov, V.; Boutet, S. et al.; Byrdin, M.; Cammarata, M.; Carbajo, S.; Christou, N. E.; Coquelle, N.; la Mora, E. D.; Khatib, M. E.; Chicano, T. M.; Doak, R. B.; Fieschi, F.; Foucar, L.; Glushonkov, O.; Gorel, A.; Grünbein, M. L.; Hilpert, M.; Hunter, M.; Kloos, M.; Koglin, J. E.; Lane, T. J.; Liang, M.; Mantovanelli, A.; Nass, K.; Nass Kovacs, G.; Owada, S.; Roome, C. M.; Schirò, G.; Seaberg, M.; Stricker, M.; Thépaut, M.; Tono, K.; Ueda, K.; Uriarte, L. M.; You, D.; Zala, N.; Domratcheva, T.; Jakobs, S.; Sliwa, M.; Schlichting, I.; Colletier, J.-P.; Bourgeois, D.; Weik, M.: Rational control of structural off-state heterogeneity in a photoswitchable fluorescent protein provides switching contrast enhancement. ChemPhysChem 23 (19), e202200192, pp. 1 - 11 (2022)

Adam, V.; Hadjidemetriou, K.; Jensen, N.; Shoeman, R. L.; Woodhouse, J.; Aquila, A.; Banneville, A.-S.; Barends, T. R. M.; Bezchastnov, V.; Boutet, S. et al.; Byrdin, M.; Cammarata, M.; Carbajo, S.; Christou, N. E.; Coquelle, N.; la Mora, E. D.; Khatib, M. E.; Chicano, T. M.; Doak, R. B.; Fieschi, F.; Foucar, L.; Glushonkov, O.; Gorel, A.; Grünbein, M. L.; Hilpert, M.; Hunter, M.; Kloos, M.; Koglin, J. E.; Lane, T. J.; Liang, M.; Mantovanelli, A.; Nass, K.; Nass Kovacs, G.; Owada, S.; Roome, C. M.; Schirò, G.; Seaberg, M.; Stricker, M.; Thépaut, M.; Tono, K.; Ueda, K.; Uriarte, L. M.; You, D.; Zala, N.; Domratcheva, T.; Jakobs, S.; Sliwa, M.; Schlichting, I.; Colletier, J.-P.; Bourgeois, D.; Weik, M.: Cover Feature: Rational control of structural off-state heterogeneity in a photoswitchable fluorescent protein provides switching contrast enhancement (ChemPhysChem 19/2022). ChemPhysChem 23 (19), e202200693, p. 1 - 1 (2022)

Doak, R. B.: Focusing of an atomic beam. arXiv, 2201.06201 , pp. 1 - 59 (2022)

Sorigué, D.; Hadjidemetriou, K.; Blangy, S.; Gotthard, G.; Bonvalet, A.; Coquelle, N.; Samire, P.; Aleksandrov, A.; Antonucci, L.; Benachir, A. et al.; Boutet, S.; Byrdin, M.; Cammarata, M.; Carbajo, S.; Cuiné, S.; Doak, R. B.; Foucar, L.; Gorel, A.; Grünbein, M.; Hartmann, E.; Hienerwadel, R.; Hilpert, M.; Kloos, M.; Lane, T. J.; Légeret, B.; Legrand, P.; Li-Beisson, Y.; Moulin, S. L. Y.; Nurizzo, D.; Peltier, G.; Schirò, G.; Shoeman, R. L.; Sliwa, M.; Solinas, X.; Zhuang, B.; Barends, T. R. M.; Colletier, J.-P.; Joffre, M.; Royant, A.; Berthomieu, C.; Weik, M.; Domratcheva, T.; Brettel, K.; Vos, M. H.; Schlichting, I.; Arnoux, P.; Müller, P.; Beisson, F.: Mechanism and dynamics of fatty acid photodecarboxylase. Science 372 (6538), eabd5687, pp. 1 - 13 (2021)

Grünbein, M. L.; Gorel, A.; Foucar, L.; Carbajo, S.; Colocho, W.; Gilevich, S.; Hartmann, E.; Hilpert, M.; Hunter, M.; Kloos, M. et al.; Koglin, J. E.; Lane, T. J.; Lewandowski, J.; Lutman, A.; Nass, K.; Nass Kovács, G.; Roome, C. M.; Sheppard, J.; Shoeman, R. L.; Stricker, M.; van Driel, T.; Vetter, S.; Doak, R. B.; Boutet, S.; Aquila, A.; Decker, F. J.; Barends, T. R. M.; Stan, C. A.; Schlichting, I.: Effect of X-ray free-electron laser-induced shockwaves on haemoglobin microcrystals delivered in a liquid jet. Nature Communications 12 (1), 1672, pp. 1 - 11 (2021)

Grünbein, M. L.; Foucar, L.; Gorel, A.; Hilpert, M.; Kloos, M.; Nass, K.; Nass Kovacs, G.; Roome, C. M.; Shoeman, R. L.; Stricker, M. et al.; Carbajo, S.; Colocho, W.; Gilevich, S.; Hunter, M.; Lewandowski, J.; Lutman, A.; Koglin, J. E.; Lane, T. J.; van Driel, T.; Sheppard, J.; Vetter, S. L.; Turner, J. L.; Doak, R. B.; Barends, T. R. M.; Boutet, S.; Aquila, A. L.; Decker, F.-J.; Schlichting, I.; Stan, C. A.: Observation of shock-induced protein crystal damage during megahertz serial femtosecond crystallography. Physical Review Research 3, 013046 , pp. 1 - 16 (2021)

Gorel, A.; Grünbein, M. L.; Bean, R.; Bielecki, J.; Hilpert, M.; Cascella, M.; Colletier, J.-P.; Fangohr, H.; Foucar, L.; Hartmann, E. et al.; Hunter, M. S.; Kirkwood, H.; Kloos, M.; Letrun, R.; Michelat, T.; Shoeman, R. L.; Sztuk-Dambietz, J.; Tetreau, G.; Zimmermann, H.; Mancuso, A. P.; Barends, T. R.M.; Doak, R. B.; Stan, C. A.; Schlichting, I.: Shock damage analysis in serial femtosecond crystallography data collected at MHz X-ray free-electron lasers. Crystals 10 (12), 1145, pp. 1 - 12 (2020)

Shilova, A.; Lebrette, H.; Aurelius, O.; Nan, J.; Welin, M.; Kovacic, R.; Ghosh, S.; Safari, C.; Friel, R. J.; Milas, M. et al.; Matej, Z.; Högbom, M.; Brändén, G.; Kloos, M.; Shoeman, R. L.; Doak, B.; Ursby, T.; Håkansson, M.; Logan, D. T.; Mueller, U.: Current status and future opportunities for serial crystallography at MAX IV Laboratory. Journal of Synchrotron Radiation 27 (5), pp. 1095 - 1102 (2020)

Grünbein, M. L.; Stricker, M.; Nass Kovács, G.; Kloos, M.; Doak, B.; Shoeman, R. L.; Reinstein, J.; Lecler , S.; Haacke , S.; Schlichting, I.: Illumination guidelines for ultrafast pump–probe experiments by serial femtosecond crystallography. Nature methods 17 (7), pp. 681 - 684 (2020)

Nass, K.; Gorel, A.; Abdullah, M. M.; Martin, A. V.; Kloos, M.; Marinelli, A.; Aquila, A.; Barends, T. R. M.; Decker, F.-J.; Doak, R. B. et al.; Foucar, L.; Hartmann, E.; Hilpert, M.; Hunter, M. S.; Jurek, Z.; Koglin, J. E.; Kozlov, A.; Lutman, A. A.; Nass Kovács, G.; Roome, C. M.; Shoeman, R. L.; Santra, R.; Quiney, H. M.; Ziaja, B.; Boutet, S.; Schlichting, I.: Structural dynamics in proteins induced by and probed with X-ray free-electron laser pulses. Nature Communications 11 (1), 1814 (2020), pp. 1 - 9 (2020)

Woodhouse, J.; Nass Kovács, G.; Coquelle, N.; Uriarte, L. M.; Adam, V.; Barends, T.; Byrdin, M.; de la Mora, E.; Doak, B.; Feliks, M. et al.; Field, M.; Fieschi, F.; Guillon, V.; Jakobs, S.; Joti, Y.; Macheboeuf, P.; Motomura, K.; Nass, K.; Owada, S.; Roome, C. M.; Ruckebusch, C.; Schirò, G.; Shoeman, R. L.; Thepaut, M.; Togashi, T.; Tono, K.; Yabashi, M.; Cammarata, M.; Foucar, L.; Bourgeois, D.; Sliwa, M.; Colletier, J.-P.; Schlichting, I.; Weik, M.: Photoswitching mechanism of a fluorescent protein revealed by time-resolved crystallography and transient absorption spectroscopy. Nature Communications 11 (741), 741, pp. 1 - 11 (2020)

Nass, K.; Redecke, L.; Perbandt, M.; Yefanov, O.; Klinge, M.; Koopmann, R.; Stellato, F.; Gabdulkhakov, A.; Schönherr, R.; Rehders, D. et al.; Lahey-Rudolph, J. M.; Aquila, A.; Barty, A.; Basu, S.; Doak, B.; Duden, R.; Frank, M.; Fromme, R.; Kassemeyer, S.; Katona, G.; Kirian, R.; Liu, H.; Majoul, I.; Martin-Garcia, J. M.; Messerschmidt, M.; Shoeman, R. L.; Weierstall, U.; Westenhoff, S.; White, T. A.; Williams, G. J.; Yoon, C. H.; Zatsepin, N.; Fromme, P.; Duszenko, M.; Chapman, H. N.; Betzel, C.: In cellulo crystallization of Trypanosoma brucei IMP dehydrogenase enables the identification of genuine co-factors. Nature Communications 11 (1), 620, pp. 1 - 13 (2020)

Andersson, R.; Safari, C.; Båth, P.; Bosman, R.; Shilova, A.; Dahl, P.; Ghosh, S.; Dunge, A.; Kjeldsen-Jensen, R.; Nan, J. et al.; Shoeman, R. L.; Kloos, M.; Doak, R. B.; Mueller, U.; Neutze, R.; Brändén, G.: Well-based crystallization of lipidic cubic phase microcrystals for serial X-ray crystallography experiments. Acta Crystallographica Section D: Structural Biology 75 (10), pp. 937 - 946 (2019)

Nass Kovács, G.; Colletier, J.-P.; Grünbein, M. L.; Yang, Y.; Stensitzki, T.; Batyuk, A.; Carbajo, A.; Doak, R. B.; Ehrenberg, D.; Foucar, L. et al.; Gasper, R.; Gorel, A.; Hilpert, M.; Kloos, M.; Koglin, J. E.; Reinstein, J.; Roome, C. M.; Schlesinger, R.; Seaberg, M.; Shoeman, R. L.; Stricker, M.; Boutet, S.; Haacke , S.; Heberle, J.; Heyne, K.; Domratcheva, T.; Barends, T. R.M.; Schlichting, I.: Three-dimensional view of ultrafast dynamics in photoexcited bacteriorhodopsin. Nature Communications 10, 3177, pp. 1 - 17 (2019)

Grünbein, M. L.; Bielecki, J.; Gorel, A.; Stricker, M.; Bean, R.; Cammarata, M.; Dörner, K.; Fröhlich, L.; Hartmann, E.; Hauf, S. et al.; Hilpert, M.; Kim, Y.; Kloos, M.; Letrun, R.; Messerschmidt, M.; Mills, G.; Nass Kovács, G.; Ramilli, M.; Roome, C. M.; Sato, T.; Scholz, M.; Sliwa, M.; Sztuk-Dambietz, J.; Weik, M.; Weinhausen, B.; Al-Qudami, N.; Boukhelef, D.; Brockhauser, S.; Ehsan, W.; Emons, M.; Esenov, S.; Fangohr, H.; Kaukher, A.; Kluyver, T.; Lederer, M.; Maia, L.; Manetti, M.; Michelat, T.; Münnich, A.; Pallas, F.; Palmer, G.; Previtali, G.; Raab, N.; Silenzi, A.; Szuba, J.; Venkatesan, S.; Wrona, K.; Zhu, J.; Doak, B.; Shoeman, R. L.; Foucar, L.; Colletier, J.-P.; Mancuso, A. P.; Barends, T.; Stan, C. A.; Schlichting, I.: MHz data collection of a microcrystalline mixture of different jack bean proteins. Scientific Data 6, 18 (2019), pp. 1 - 6 (2019)

Schulz, J.; Bielecki, J.; Doak, B.; Dörner, K.; Graceffa, R.; Shoeman, R. L.; Sikorski, M.; Thute, P.; Westphal, D.; Mancuso, A. P.: A versatile liquid-jet setup for the European XFEL1. Journal of Synchrotron Radiation 26 (2), pp. 339 - 345 (2019)

Pande, K.; Donatelli, J. J.; Malmerberg, E.; Foucar, L.; Poon, B. K.; Sutter, M.; Botha, S.; Basu, S.; Doak, B.; Dörner, K. et al.; Epp, S. W.; Englert, L.; Fromme, R.; Hartmann, E.; Hartmann, R.; Hauser, G.; Hattne, J.; Hosseinizadeh, A.; Kassemeyer, S.; Lomb, L.; Montero, S. F. C.; Menzel, A.; Rolles, D.; Rudenko, A.; Seibert, M. M.; Sierra, R. G.; Schwander, P.; Ourmazd, A.; Fromme, P.; Sauter, N. K.; Bogan, M.; Bozek, J.; Bostedt, C.; Schlichting, I.; Kerfeld, C. A.; Zwart, P. H.: Free-electron laser data for multiple-particle fluctuation scattering analysis. Scientific Data 5 (180201), pp. 1 - 7 (2018)